Pokémon Box Rubino/Zaffiro è stato messo in vendita in Europa il 14 Maggio 2004, e consisteva come deposito Pokémon per i videogiochi Rubino, Zaffiro, Smeraldo, Rosso Fuoco e Verde Foglia.
Il gioco ha a disposizione 25 box per la memorizzazione di 1500 pokémon, fornendo tutte le info: informazioni generali, EV, mosse, fiocchi ricevuti. Il trasferimento avviene tramite il cavo Game Link.